实验室自成立以来，制定了各类规章制度，包括学术交流活动制度、实验室管理制度、实验室安全和卫生条例、仪器设备管理制度、仪器室管理规定、实验室主任会议制度、财务制度、实验室公章使用规定、开放基金管理规定及2016年修订后的开放课题管理办法等文件。在日常管理上，坚持主任领导下的分工负责制，明确研究人员、技术人员和管理人员的具体责任范围，严格遵守学校规定的各项财务、科研、安全、教学等规章制度。在学术道德建设方面，加强宣传和严格管理，严禁杜绝编造、抄袭实验数据的情况发生，指导研究生以实事求是的科学态度对待科学研究。

发挥学术委员会作用方面，建立了实验室主任、学术委员会主任联席会议制度，及时讨论实验室的工作进展，认真听取学术委员会的建议和意见。学术活动方面，积极推进实验室内部的学术交流活动，积极邀请国内外著名学者来实验室讲学，坚持各学术小组间相互交叉的讲座活动及各研究方向教授间跨学科的合作，积极营造良好的科研氛围。